Liver_References · 合并 Dashboard
database_unified/Liver_References/ · 18 原文件 + 3 合并派生视图 · 生成于 2026-05-15 · 增量更新 2026-05-16 (+1 GEO · GSE153643) · ⚠ Wave 2 增量 2026-05-17 (+5 HCC/iCCA tumor files) 未反映
⚠ 2026-05-17 Wave 2 增量 — KPI / 图表仍为 18-file v1 snapshot
本次会话沙盒 ingest 完成 5 个新 .h5ad(Liver_References 18 → 23 文件,cells 349k → 489k),新增子包 E·Ma 2019 HCC/iCCA mixed · F·Ma 2021 HCC/iCCA treatment · G·Sharma 2020 HCC CD45+ Droplet+ss2。完整 dashboard 重做留作后续。当前请参阅:
1. 合并映射 — 哪些原文件 → 哪个派生视图
3 次合并对应"sc healthy per-cell-type 统一 / visium healthy C73 三切片统一 / visium PSC PSC011 四切片统一"。剩 2 个 all-cells 文件(sc + sn)已是各自的全集,不进合并。
2. sc healthy 合并 · cell type 组成
107,542 个健康肝细胞按 8 种 cell type subset 的分布。
3. visium 合并 · per-block spot 数
所有 7 个 Visium 切片每块 spot 数均为 4,992(10x Visium 标准芯片)。
4. 跨文件供体矩阵 · 22 独立供体的模态贡献
每位供体在 scRNA / snRNA / Visium 三种模态下贡献的 cells/spots。C-series = 健康对照(9 人),PSC*** = 原发性硬化性胆管炎患者(10 人),PBC*** = 原发性胆汁性胆管炎患者(3 人)。
5. Visium 切片 H&E 缩略图 · 7 块切片
每块 hires 图(约 2000×2000 像素)缩略至 400px,已 base64 内嵌。C73 是健康捐献者(3 块),PSC011 是 PSC 患者(4 块)。
6. 18 原文件清单(17 CELLxGENE + 1 GEO · 保持不变)
所有原 UUID 文件在合并后保持物理位置 + 内容 + 大小不变。点击 UUID8 查看简要元信息。
Liver_References 数据集 · DOI 10.1016/j.jhep.2023.12.023 · CZ CELLxGENE collection 0c8a364b · schema 7.0.0